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Introducción.Las micobacterias ambientales (también llamadas micobacterias atípicas, micobacterias no tuberculosas o micobacterias distintas de Mycobacterium tuberculosis), son un grupo fascinante de patógenos de mamíferos, de aves y oportunistas humanos, que pueden provocar morbilidad y mortalidad humana e impactos económicos importantes en la agricultura. Material y método.Se realizó un estudio Descriptivo de Corte Transversal y retrospectivo utilizando aislamientos de micobacterias en muestras de esputos procesadas en el Laboratorio de Micobacterias del Laboratorio Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología (LPHEM) de Santiago de Cuba en el período de Enero de 2012 a Diciembre de 2013. El universo estuvo constituido por 250 aislamientos, quedando constituida la muestra por 61 aislamientos A cada cepa se realizó examen directo (coloración de Ziehl Neelsen), a los que resultaron BAAR (Bacilo Ácido Alcohol Resistente) se realizó Prueba de TB Ag MPT64 Rapid para la identificación de grupo y se envió al Centro nacional de Referencia para identificación de especie.Resultados. Se encontró. La mayoría de las cepas aisladas de M. no tuberculosas procedían de muestras de pacientes del sexo masculino, de 45 a 55 años y diagnosticados fundamentalmente en hospitales y el área de Julián Grimau. La Prisión Boniato aportó el mayor porciento de casos de micobacteriosis notificados como caso TB. El mayor porciento fue de crecimiento lento y no pigmentadas, siendo la M. avium- intracellulare la más frecuente dentro de las especies identificadas con el mayor número de BK positivo. Conclusión.Se realizó un análisis de la problemática existente derivada del estudio determinándose las necesidades objetivas y subjetivas que requieren de atención para enfrentar las mismas.